《非居民企業(yè)所得稅源泉扣繳管理暫行辦法》（國稅發(fā)[2009]3號）規(guī)定，扣繳義務(wù)人未按照規(guī)定辦理扣繳稅款登記的，主管稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)當(dāng)按照《稅務(wù)登記管理辦法》第四十五條、四十六條的規(guī)定處理。即扣繳義務(wù)人未按照規(guī)定辦理扣繳稅款登記的，稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)當(dāng)自發(fā)現(xiàn)之日起3日內(nèi)責(zé)令其限期改正，并可處以2000元以下的罰款；納稅人、扣繳義務(wù)人違反《稅務(wù)登記管理辦法》規(guī)定，拒不接受稅務(wù)機(jī)關(guān)處理的，稅務(wù)機(jī)關(guān)可以收繳其發(fā)票或者停止向其發(fā)售發(fā)票。

　　此外，《非居民企業(yè)所得稅源泉扣繳管理暫行辦法》（國稅發(fā)[2009]3號）還規(guī)定，扣繳義務(wù)人未按規(guī)定的期限向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)報送《扣繳企業(yè)所得稅合同備案登記表》、合同復(fù)印件及相關(guān)資料的，未按規(guī)定期限向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)報送扣繳表的。未履行扣繳義務(wù)不繳或者少繳已扣稅款的、或者應(yīng)扣未扣稅款的，非居民企業(yè)未按規(guī)定期限申報納稅的、不繳或者少繳應(yīng)納稅款的，主管稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)當(dāng)按照《稅收征管法》及其實(shí)施細(xì)則的有關(guān)規(guī)定處理。對于扣繳義務(wù)人未履行扣繳義務(wù)不繳或者少繳已扣稅款的、或者應(yīng)扣未扣稅款的，《稅收征管法》規(guī)定，扣繳義務(wù)人應(yīng)扣未扣、應(yīng)收而不收稅款的，由稅務(wù)機(jī)關(guān)向納稅人追繳稅款，對扣繳義務(wù)人處應(yīng)扣未扣、應(yīng)收未收稅款百分之五十以上三倍以下的罰款。

　　[例]境外投資者A為非居民企業(yè)，于2008年1月投人中國居民企業(yè)B公司美元現(xiàn)匯210萬美元，投入當(dāng)期美元對人民幣匯率為1：7.8087，同年6月投入B公司歐元現(xiàn)匯50萬歐元，投入當(dāng)期歐元對人民幣匯率為1:10.4999；2008年10月投入港幣現(xiàn)匯250萬元，投入當(dāng)期港幣對人民幣匯率為1:0.9683。該公司經(jīng)審驗(yàn)后的注冊資本折合人民幣金額是210×7.8087+50×10.4999×250×0.9683，即2406.90萬元。2010年1月投資者A公司將該股權(quán)轉(zhuǎn)讓給境內(nèi)投資者C，其轉(zhuǎn)讓價款為人民幣6000萬元，當(dāng)時美元對人民幣的匯率為1:6.285。

　　由于投資者A首次投入資本時的幣種為美元。則股權(quán)轉(zhuǎn)讓價和股權(quán)成本價以美元計算，首先考慮將不同期間的歐元、港幣外匯折算為美元的匯率。
　　2008年6月歐元兌美元匯率=770.55/1049.99≈0.7339
　　2008年10月美元兌港幣匯率=751.08/96.83≈7.7567
　　2009年12月美元兌人民幣匯率=6.8285

　　計算股權(quán)轉(zhuǎn)讓價=6000萬人民幣／6.8285=878.67（萬美元）

　　股權(quán)轉(zhuǎn)讓成本：第一次為210萬美元，第二次為68.13萬美元（50萬歐元／0.7339），第三次為32.23萬美元（250萬歐元／7.7567），合計為310.36萬美元。
　　股權(quán)轉(zhuǎn)讓所得=878.67-310.36=568.31（萬美元）
　　股權(quán)轉(zhuǎn)讓應(yīng)納所得稅=568.31萬美元×100%×6.8285=388.07（萬元）人民幣